תהליך ההכנה נעשה בליווי צמוד והדרכה של מתאמת השתלות מח עצם, סיווג רקמות ואיתור תורם (במקרה של השתלה מתורם), הערכה כללית של המטופל.ת ומידת התאמה ע”י בדיקות דם, הערכת תפקודי לב וריאות, הערכה דנטלית, ושימור פוריות.
לקראת האישפוז מוכנס צנתר מרכזי ביחידת האנגיוגרפיה של בית החולים.